Research Group Deponte

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Lectures & Seminars

Protein biochemistry (German)

Lecturer: M. Deponte

Course: See here

Term: Summer semester

 

Venue & Time:

HS 52-207 / Wed 845 - 930 

HS 52-204 / Tue 900 - 1030

 

Content:

  • Advanced amino acid metabolism (rep. proteinogenic amino acids, enzyme mechanisms, connections with carbon metabolism, mediators/hormons/neurotransmitters, nitrogen excretion)
  • Protein structure (rep. primary to quaternary structure, folding problem, structure-function relationships)
  • Intracellular protein turnover (synthesis, folding, sorting, secondary modifications, degradation)
  • Protein production and purification (methods in research & industry)

 

Material:

Vorlesung 1 (Aminosäuremetabolismus)

Vorlesung 2 (Aminosäuremetabolismus)

Seminar 1 (Aminosäuremetabolismus)

Vorlesung 3 (Aminosäuremetabolismus)

Seminar 2 (Proteinstruktur)

Vorlesung 4 (Proteinstruktur)

Seminar 3 (Proteinstruktur)

Vorlesung 5 (Proteinumsatz)

Seminar 4 (Proteinumsatz)

Vorlesung 6 (Proteinumsatz)

Seminar 5 (Proteinumsatz)

Vorlesung 7 (Proteinumsatz)

Vorlesung 8 (Proteinumsatz)

Seminar 6 (Proteinumsatz)

Vorlesung 9 (Proteinumsatz)

Seminar 7 (Proteinumsatz)

Vorlesung 10 (Proteinumsatz)

Vorlesung 11 (Proteinreinigung)

Seminar 8 (Proteinreinigung)

Vorlesung 12 (Proteinreinigung)

Seminar 9 (Proteinreinigung)

 

 

Tests:

Klausur Proteinbiochemie 17.07.2017

Nachholklausur Proteinbiochemie 02.11.2017

Klausur Proteinbiochemie 16.07.2018

Nachholklausur Proteinbiochemie 25.10.2018

Klausur Proteinbiochemie 15.07.2019

Nachholklausur Proteinbiochemie 29.10.2019

Microbial biochemistry II (Engl.)

Lecturer: M. Deponte

Course: See here

Term: Summer semester

 

Venue & Time:

To be announced 

 

Content:

  • Overview and phylogeny of parasitic protists
  • Special cell organelles and metabolic pathways
  • Molecular parasitology
  • Drug development (screening vs. rational drug design, target identification)
  • Resistance mechanisms

 

Material:

Lecture 1

Lecture 2

Lecture 3

Lecture 4

Lecture 5

Lecture 6

Lecture 7

Lecture 8

 

Tests:

Oral test for groups < 8 persons

Comparative biochemistry (German)

Lecturer: M. Deponte

Course: See here

Term: Winter semester

 

Venue & Time:

HS 52-204 / Mon 1145 - 1315 

HS 46-280 / Wed 845 - 930

 

Content:

  • Introduction (organismic diversity, metabolic compartmentalization)
  • Comparison of metabolic pathways (examples of analogous & differing reactions, purine and pyrimidine metabolism)
  • Model systems and applications (eukaryotic and prokaryotic model systems, molecular tools)
  • Comparison of pro- and eukaryotes (energy metabolism, information systems, growth and reproduction, optional: defence & immune systems or motility)

 

Material:

Vorlesung 1 (Einführung)

Vorlesung 2 (Einführung)

Vorlesung 3 (Einführung)

Vorlesung 4 (Vergleich von Stoffwechselwegen)

Vorlesung 5 (Vergleich von Stoffwechselwegen)

Vorlesung 6 (Vergleich von Stoffwechselwegen)

Vorlesung 7 (Vergleich von Stoffwechselwegen)

Vorlesung 8 (Modellsysteme und Anwendungen)

Vorlesung 9 (Modellsysteme und Anwendungen)

Vorlesung 10 (Modellsysteme und Anwendungen)

Vorlesung 11 (Vergleich Pro- und Eukaryoten)

Seminar 1 (Proteinvisualisierung)

Seminar 2 (Proteinvisualisierung)

Seminar 3 (Proteinvergleich)

Seminar 4 (Lipidrepetitorium)

Seminar 5 (Kohlenhydratrepetitorium)

Seminar 6 (Basenrepetitorium)

Seminar 7 (Modellsysteme und Anwendungen)

Seminar 8 (Modellsysteme und Anwendungen)

Seminar 9 (Modellsysteme und Anwendungen)

Seminar 10 (Modellsysteme und Anwendungen)

Seminar 11 (Vergleich Pro- und Eukaryoten)

 

Tests:

Klausur vergleichende Biochemie 14.03.2018

Nachholklausur vergleichende Biochemie 16.05.2018

Klausur vergleichende Biochemie 13.03.2019

Nachholklausur vergleichende Biochemie 17.05.2019

Enzymology (Engl.)

Lecturer: M. Deponte

Course: See here

Term: Winter semester

 

Venue & Time:

Room 54-656 / Tue 900 - 1045 

 

Content:

  • Enzyme classification
  • Principles of enzyme catalysis
  • Steady-state and pre-steady state kinetics
  • Reversible and irreversible reactions
  • Enzyme inhibitors
  • Allostery and cooperativity
  • Data analysis and evaluation
  • Selected enzyme mechanisms and examples

 

Material:

Lecture 1

Lecture 2

Lecture 3

Lecture 4

Lecture 5

Lecture 6

Lecture 7

Kinetic data excercise

 

Tests:

Klausur Enzymology 05.02.2019

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