Research Group Pierik

Teaching

Prof. Dr. Antonio Pierik

Lectures & Seminars

Bachelor: Grundlagen der Biochemie und allgemeiner Stoffwechsel (Biochemie I)

Dozent: Prof. Dr. Antonio J.Pierik

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Wann?: Wintersemester

 

Wo und wann?:

Hörsaal 52-207 / Montag 815 - 945 

Hörsaal 46-210 / Donnerstag 815 - 945

Die Klausureinsicht Biochemie I findet am Freitag, den 13.3.2020, im Raum 52-416A von 9h30-11h30 statt. Alle Noten sind jetzt in QIS hinterlegt worden.

Inhalt der Vorlesung:

  • Biologische Makromoleküle und ihre Bausteine: Aminosäuren, Proteine, Einführung Proteinanalytik, Nucleotide, Kohlenhydrate, Lipide
  • Funktionen biologischer Moleküle: Enzyme und deren Mechanismen, Einführung Enzymkinetik, Coenzyme, Kofaktoren, Hormone, Hämoglobin, biologische Membranen
  • Stoff- und Energiewechsel: Allgemeines, Glykolyse, Gluconeogenese, Citratzyklus, Atmungskette, Fettsäureabbau, Fettsäuresynthese, Funktion der Peroxisomen, Regulation des Stoffwechsels, Pentosephosphatweg, Photosynthese, Calvin-Zyklus

Unterlagen:

(Zugriff über login mit Name und Passwort, wird in der Vorlesung bekannt gegeben)

1. Einführung und Aminosäuren WS19/20 2. Chiralität & Peptid-Bindung WS19/20
3. & 4. Proteinreinigung und -analytik, Strukturbestimmung WS19/20
5. Struktur von Proteinen WS19/20
6. Enzyme und Kinetik WS19/20
7. Cofaktoren und Kohlenhydrate WS19/20
8. & 9. Glykolyse, Fermentation und PDH WS19/20
10. & 11. Citratzyklus und Atmungskette WS19/20
12. Gluconeogenese und O2-Transport WS19/20
13. Membranlipide WS19/20

(Die weiteren Vorlesungen sind nicht für die Klausur bei Lehramt)
14. Sonstige Lipide WS19/20 15. &16. Fettsäureabbau und Synthese WS19/20
17. Photosynthese WS19/20
18. Pentosephosphatweg und Calvin-Zyklus WS19/20

Die Klausureinsicht Biochemie I findet am Freitag, den 13.3.2020, im Raum 52-416A von 9h30-11h30 statt. Alle Noten sind jetzt in QIS hinterlegt worden.

Übungen zur Biochemie I

Blatt 1 Blatt 2 Blatt 3 Blatt 4 Blatt 5 Blatt 6 Blatt 7 Blatt 8 Blatt 9

Klausuren zur Biochemie I:

Klausur BC1 27.02.2019Klausur BC1 18.04.2019
Klausur BC1+2 01.08.2019
Klausur BC1 29.10.2019 Klausur BC1 05.03.2020

 

Master: Structural Biochemistry

Teacher: Prof. Dr. Antonio J.Pierik

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When?: Wintersemester

 

Where and when?:

In room 52-320/ Tuesday 1100 - 1245

 

Content of the Lecture Structural Biochemistry:

  • Disulfide bonds in proteins
  • Folding, conformation and flexibility
  • Cis-proline in proteins
  • UV-Vis, fluorescence, EPR
  • CD spectroscopy
  • Mass spectrometry
  • N-terminal mitoproteome
  • X-ray crystallography
  • Cryo-electron microscopy
  • Structure and function I
  • ß-Propeller proteins
  • Structure and function II
  • P450 and aromatase
  • Glutathion and oxidative stress
  • Ribonucleotide reductase
  • Application of structural data, mutagenesis
  • Random mutagenesis
  • Posttranslational modification
  • Proline hydroxylation

 

Unterlagen:

(Zugriff über login mit Name und Passwort, wird in der Vorlesung bekannt gegeben)

0. Introduction (no lecture, for preparation)
1. Folding, conformation and flexibility
2. X-ray crystallography
    Anna-Lisa Voigt: ABC transporters
3. Cryoelectron microscopy
    Yuriy Chertkov: Deactivated bovine Complex I
    Sonia Uwurukundo: Carotenoid breakdown
4. NMR spectroscopy
    Lukas Hewener: Monomeric cytochrome c oxidase
5. Mass spectrometry
    Maxim Bodimer: Viperin function
    Anna-Lena Katzke: Cysteine dioxygenase
6. Cytochrome P450
    Valerie Rebhahn: Lysine hydroxylation
7. Hands-on training of structural modelling
8. ESR spectroscopy
    Thomas Frick: Polymerase delta
9. FTIR spectroscopy
    Sandra Nungess: Dihydroxyacid dehydratase as herbicidal target
10. Oxidative stress
Schlüsselfolien WS 2019/20

Klausur SB 25.01.18

Klausur SB 01.02.19

Klausur SB 17.02.20

Bachelor: Nucleinsäuren und Proteinbiosynthese (Biochemie II)

Dozent: Prof. Dr. Antonio J.Pierik

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Wann?: Sommersemester

 

Wo und wann?:

Hörsaal 52-206 / Donnerstag 800 - 930

 

Inhalt der Vorlesung Nucleinsäuren und Proteinbiosynthese:

  • Struktur und Funktion von Nukleotiden, Chromatin, DNA, RNA, DNA-Reparatur, Telomere
  • Biosynthese von Desoxynucleotiden, DNA, RNA, Proteinen (Replikation, Transkription (auch revers), Translation)
  • Posttranskriptionale und posttranslationale Prozesse
  • Regulation der Genexpression auf verschiedenen Stufen
  • Proteinsortierung
  • Gentechnik

 

Unterlagen:

(Zugriff über login mit Name und Passwort, wird in der Vorlesung bekannt gegeben)

1. DNA, RNA 2019 2. Replikation 2019
3. DNA-Packung und Telomere 2019
4. DNA-Reparatur 2019 5. Transkription 2019 6. Regulation 2019
7. Genetischer Code und tRNA 2019
8. Ribosomen 2019 9. Proteinsortierung 2019
10. Transkription und Translation bei Eukaryoten 2019
11. Restriktion und Gentechnologie 2019

Übungen zur Biochemie II

Blatt 1 Blatt 2 Blatt 3 Blatt 4 Blatt 5 Blatt 6 Blatt 7 Blatt 8 Blatt 9/10

Klausuren zur Biochemie I+II und II:
Klausur BC1+3 26.07.2018
Klausur BC1+3 30.10.2018 Klausur BC1+2 01.08.2019
Klausur BC1+2 29.10.2019

Master: Microbial Biochemistry I

Teacher: Prof. Dr. Antonio J.Pierik

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When?: Sommersemester

 

Where and when?:

Place will be announced/Tuesday and/or Thursday 1500 - 1700

 

Content of the Lecture Microbial Biochemistry I:

  • Radical SAM enzymes
  • Glycyl radical enzymes
  • Hydrogenases
  • Oxygen-tolerant hydrogenases
  • Nitrogenases
  • Nitrogenase and symbiosis
  • Methanogenesis
  • Reverse methanogenesis
  • Pyrrolysine
  • Selenocysteine
  • Amino acid fermentation
  • Electron bifurcation
  • Sulfate reduction
  • (Siro)Heme biosynthesis
  • Biotechnology: isobutanol production
  • Biotechnology: lysine production

 

Unterlagen:

(Zugriff über login mit Name und Passwort, wird in der Vorlesung bekannt gegeben)

Overview of the lectures

1. Hydrogenase
2. Radical SAM enzymes
    Elyssa Dubois: A glycyl radical enzyme breaking down hydroxyproline
3. Nitrogenase
    Egide Sibomana: Site-specific oxidation state assignments in nitrogenase
4. Acetogenesis and methanogenesis
    Fidel Munyaneza: Biosynthesis of F430
5. Sulfate reduction
    Julia Schulz: Design of an artificial sulfite reductase
6. Pyrrolysine
7. Amino acid fermentation
    Thomas Schömann: Aromatic amino acids in the gut

Keyslides for the exam

Klausur 15.08.18

Klausur 16.08.19


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